水體污染控制與治理科技重大專項（以下簡稱“水專項”）旨在解決制約我國社會經濟發展的水污染重大瓶頸問題,構建我國流域水污染治理技術體系和水環境管理技術體系，為重點流域污染物減排、水質改善和飲用水安全保障提供強有力科技支撐。
　　
　　水專項實施8年來，按照“控源減排”、“減負修復”和“綜合調控”的步驟，圍繞遼河、海河、淮河、太湖、滇池、巢湖等重點流域開展科技攻關和工程示范。共建設了500余項科技示范工程，已獲得授權專利1400余項，提出300余項標準和技術規范，為《水污染防治行動計劃》的實施提供了強有力的科技支撐，較好地完成了階段性任務和目標，提升了本領域的科技創新能力，為后期水專項的實施奠定了基礎。
　　
　　環境保護部科技標準司副司長劉志全介紹說，迄今，水專項共研發了1000余項關鍵技術，取得7個方面技術成果：一是深化水生態功能分區的原理與方法，構建流域水質目標管理體系，研發水環境關鍵指標的在線監測與遙測、預警預報關鍵技術；二是研發化工、輕工、冶金、紡織印染、醫藥等5個重點行業的污水處理關鍵技術，對造紙和食品等行業廢水的資源化處理取得了新進展；三是建立城市水環境系統功能定位、源解析及其水質響應的新方法，開發城市污水提標改造關鍵技術；四是研發湖泊藍藻水華暴發的監測、預警應用技術，構建藍藻水華的攔截、收集濃聚與處置利用技術系統；五是研發多類型湖濱帶生態修復技術，建立入湖河流水質生物生態強化凈化工藝；六是開發微污染飲用水源水質改善、監測預警及針對突發性污染事故應急供水凈化關鍵技術，建立高藻、高有機物、高氨氮、含嗅味原水處理及有毒副產物控制新工藝；七是提出跨界生態補償與水污染賠償等政策措施，在典型流域試行排污許可證制度。
　　
　　在遼河流域，建立了遼、渾、太干流城市群及源頭和河口區示范區，開展行業、城鎮污水治理和水環境修復示范，支撐遼河流域“十二五”期間干支流全面消除劣V類水質，干流全面達到IV類水。在海河流域，建成了北運河（北京段）、北三河（天津段）和子牙河（河北段）3個河流水質改善成套整裝技術集成綜合示范區。在淮河流域，構建并實施了基于廢水資源化與水質目標管理的多閘壩基流匱乏型重污染河流“三三三”治理模式。在太湖流域，重點突破了系統控源減排、清水流域修復、城市黑臭河道整治等關鍵技術，建立了太湖西北部竺山灣和太湖新城、貢湖灣等綜合示范區。在滇池流域，緊密結合流域污染防治規劃和地方重點治污工作，研發了基于固相碳源脫氮入河面源污染控制等多項技術，建立了新寶象河入湖河流小流域綜合示范區。在巢湖流域，按照控源減排減總量、生態修復擴容量的思路，建立了南淝河和十五里河重污染入湖河流綜合示范區，實現在示范區水質消除劣Ⅴ類的目標。
　　
　　“十三五”是水專項的收官階段。水專項領導小組將按照國務院和三部門的統一要求，充分發揮各成員單位和行業牽頭組織部門的作用，堅決聚焦瘦身，將專項流域綜合示范資金和項目重點聚焦到京津冀區域和太湖流域。
　　
　　水專項河流主題專家組組長、中科院生態中心研究員單保慶介紹說，京津冀區域立足解決京津冀一體化面臨的重大水環境水安全問題。要以城市黑臭水體消除和水生態文明建設為核心，以水資源-水污染-水生態“三位一體”協同解決的系統工程思路為主要技術路線，實施一批大型水環境綜合整治工程，帶動京津冀核心區（北京-廊坊-天津）水環境質量實現根本性轉變。要以京津冀地區重要水源地保護及供水安全保障為方向，建成一批水源水質風險防范、監控預警與安全供水全過程保障的民生工程，為京津冀飲用水安全長效保障機制夯實技術基礎。要以冬奧會水生態與水安全保障重大需求為目標，按照“山水林田湖”一體化生態保護的技術路線，實施一批以水源地涵養、河流生態修復與水安全保障平臺建設創新工程，為冬奧會高水平舉辦提供強有力的技術支撐。要以水資源與水環境一體化管理為抓手，創新京津冀跨區域水環境水資源一體化管理制度；以試驗區先行先試的方式，形成以提高水環境質量為核心的新型管理體系，為革新現有水環境管理制度和相關政策法規提供技術支撐和實施案例。
　　
　　水專項監督評估專家組組長、中國工程院院士張全興介紹說，太湖流域將針對湖泊流域控源減負與水質目標耦合失衡、藍藻水華暴發、湖泊水生態系統功能退化等水環境問題，開展湖泊流域氮磷污染精準控制、水循環重構和水生態系統重建、飲用水品質提升、流域水環境質量監控、以及水環境管理政策和平臺的技術研究，并在太湖全流域（一湖）開展精準化大數據智慧環保管理平臺構建和業務化運行，開展污染物深度削減、生態重點修復和飲水水質全面提升的工程技術綜合示范，形成富營養化湖泊水環境污染控制和水環境管理兩大技術體系，為完成太湖流域乃至全國湖泊水環境治理目標提供有力的科技支撐。
　　
　　水專項在今后的實施過程中，將徹底分離水專項科技目標和治理目標，注重重大成果的應用。要大膽創新體制機制，明確各方責任。要實現專家專職化，改革項目遴選機制，嚴格工程管理，防控廉政風險。